UPT Puskesmas Botania mempunyai wilayah kerja di satu kelurahan yaitu Kelurahan Belian, Kecamatan Batam Kota. Luas wilayah daratan Kelurahan Belian yaitu sebesar 17.683 km2 dan luas lautannya 7.248 km2 (sumber : Data Profil Kelurahan Belian 2017).
Batas wilayah UPT Puskesmas Botania :
1. Sebelah Utara berbatasan dengan Kelurahan Sambau.
2. Sebelah Selatan berbatasan dengan Kelurahan Muka Kuning.
3. Sebelah Baratberbatasan dengan Kelurahan Batu Besar.
4. SebelahTimur berbatasan dengan Kelurahan Baloi Permai.
